امروز : سه شنبه 16 خرداد 1402
با سلام. در این مطلب به نحوه طراحی یا بهتر بگم دریافت پرایمر های مربوط به ژن مورد نظر با استفاده از پایگاه داده Ncbi می پردازیم. همانطور که میدانید پایگاه داده ی Ncbi دارای بخش های بسیار زیادی می باشد که مطمئنن یکی از مهمترین بخش های آن بخش پرایمر بلست (Primer blast) می باشد که از اینجا قابل دسترسی می باشد. هرچند از منوی اول سایت و گزینه بلست نیز می توانید به مجموعه ابزارهای Blast دسترسی پیدا کنید. در پست های قبل نحوه دریافت توالی ژن رو به صورت کامل بهتون آموزش دادم که می تونید از اینجا به پست مربوطه رفته و آن را در صورت نیاز مطالعه کنید. در مرحله اول لازم است شما توالی خود را وارد کنید.
پرایمرها بدون شک مهمترین قسمت از کارکردهای آزمایشگاهی یک زیست شناس می باشد که باید با انواع آن و کاربردشان آشنا شد و به خوبی ویژگی های هرکدام را یاد گرفت تا خطایی در آینده برای توالی ایجاد نشود. در این پست انواع پرایمرهای که پرکاربردترین می باشد معرفی می شود.
پرایمرها نوعی الیگونوکلئوتید هستند که برای تکمیل رشته‌های DNA و RNA استفاده می‌شوند. پرایمرها به دلیل دقت بالا و سرعت بالای واکنش‌های PCR به عنوان یکی از ابزارهای اصلی در تکثیر DNA و در تحقیقات بیولوژی مولکولی و ژنتیک مورد استفاده قرار می‌گیرند. برخی از انواع پرایمرهای زیستی به شرح زیر می‌باشد:
پرایمرهای استاندارد: پرایمرهای استاندارد عموماً با طول 18 تا 25 نوکلئوتید هستند و به عنوان پرایمرهای استفاده شده در بیشتر واکنش‌های PCR شناخته می‌شوند.
پرایمرهای مخصوص: این پرایمرها معمولاً برای تکثیر DNA یا RNA با بخش‌های خاص مورد استفاده قرار می‌گیرند. به عنوان مثال، پرایمرهای مخصوص می‌توانند برای تشخیص ژن‌های خاص یا ساخت DNA کمپلمانتر مورد استفاده قرار گیرند.
پرایمرهای قدرتمند: این پرایمرها برای تکثیر تعداد کمی DNA با طول بلند و یا بخش‌های کمپلکس و چالش برانگیز طراحی شده‌اند.
پرایمرهای پانل: این پرایمرها برای تحلیل همزمان چند ژن مختلف در یک نمونه استفاده می‌شوند.
کاربرد پرایمرها در تحقیقات بیولوژی و پزشکی شامل موارد زیر است: