پایگاه داده زیستی

پایگاه‌های داده بیوانفورماتیک (Bioinformatics databases)، مجموعه‌ای از داده‌های بزرگ و ساختارمند مرتبط با بیولوژی مولکولی و ژنتیک هستند که به صورت آنلاین در دسترس هستند. این پایگاه‌ها شامل اطلاعات متنوعی از جمله توالی‌های DNA و پروتئین‌ها، تنظیمات ژنتیکی، معلومات برای پیش‌بینی ساختار سه بعدی پروتئین‌ها، ترجمه معنایی و پست‌ترجمه معنایی ژن‌ها، رویدادهای بیوشیمیایی، اطلاعات فرهنگ باکتریایی و ویروسی و غیره می‌باشند.

بعضی از مشهورترین پایگاه‌های داده بیوانفورماتیک عبارتند از:

1. نرم‌افزار BLAST که برای جستجوی توالی‌های DNA و پروتئین در پایگاه‌های داده مختلف مورد استفاده قرار می‌گیرد.

2. پایگاه داده UniProt که بیش از ۲۰۰ میلیون رکورد از توالی‌های پروتئینی را شامل می‌شود.

3. پایگاه داده NCBI GenBank که بیش از ۱۶۰ میلیون رکورد از توالی‌های DNA و RNA را شامل می‌شود.

4. پایگاه داده Ensembl که برای تحلیل ژنوم‌ها و اطلاعات ژنتیکی مورد استفاده قرار می‌گیرد.

5. پایگاه داده RCSB PDB که اطلاعات ساختاری پروتئین‌ها را در اختیار قرار می‌دهد.

6. پایگاه داده KEGG که برای بررسی مسیرهای زیستی و تابع بخش‌های مختلف سلول مورد استفاده قرار می‌گیرد.

7. پایگاه داده STRING که برای تحلیل تعاملات پروتئینی و شبکه‌های پروتئینی مورد استفاده قرار می‌گیرد.