امروز : سه شنبه 16 خرداد 1402
الیگو 7 بدون شک یکی از بهترین نرم افزارهای مرتبط با طراحی پرایمر می باشد که به راحتی به شما امکان طراحی دستی و همچنین اتوماتیک را با وارد کردن ویژگی های دلخواه و مد نظر شما می دهد. در ادامه مطلب همراه ژنیک باشید تا با امکانات کامل این نرم افزار مشهور آشنا شوید.
نرم‌افزار Oligo یک نرم‌افزار تجاری برای طراحی و شبیه‌سازی الیگونوکلئوتیدها (DNA و RNA) است. این نرم‌افزار از طراحی الیگونوکلئوتیدهای PCR، طراحی پرایمرها، بررسی ساختار دوم DNA و RNA و تعیین دمای ذوب محصولات PCR و hybridization استفاده می‌کند.
Oligo دارای ابزارهای مختلفی برای تحلیل و طراحی الیگونوکلئوتیدها است، از جمله:
به کمک Oligo می‌توان به راحتی الیگونوکلئوتیدهای مورد نیاز را طراحی کرده و به تحقیقات بیولوژیکی و پزشکی کمک کرد.
نرم افزار Oligo یک نرم افزار محاسباتی است که برای طراحی و شبیه‌سازی آمپلیفیکاسیون PCR (پلیمراز زنجیره‌ای) استفاده می‌شود. این نرم افزار با توجه به توالی DNA هدف و شرایط آمپلیفیکاسیون (مانند دمای انجام واکنش و ترکیبات ریاکشن)، تعیین می‌کند که چه پرایمرهایی باید برای آمپلیفیکیشن استفاده شوند و چگونه شرایط آمپلیفیکیشن باید تنظیم شوند.
از مزایای استفاده از نرم افزار Oligo، افزایش دقت در طراحی آمپلیفیکاسیون و کاهش خطر واکنش های ناکام، کاهش هزینه ها و زمان طراحی و افزایش سرعت اجرای واکنش ها می‌باشد.
این نرم افزار برای محققان و علم‌پژوهانی که در زمینه ژنتیک، بیوشیمی و بیوتکنولوژی فعالیت می‌کنند، بسیار مفید است.
نرم افزار Oligo را می توان به عنوان یک ابزار ضروری و لازم برای طراحی و تجزیه و تحلیل پرایمر های PCR، ژن های مصنوعی و انواع مختلف پروب ها (probe) از جمله siRNA و molecular beacons نام برد. الگوریتم های جستجو در Oligo، بر مبنای جدیترین اطلاعات، پرایمرهای بهینه شامل Taqman, highly multiplexed, consensus یا پرایمرهای degenerate را برای PCR پیدا می کنند. در این نرم افزار پردازش گروهی فایل ها امکان پذیر بوده و علاوه بر این می توان از آن به عنوان ابزاری ارزشمند در تشخیص جهش های ژنتیکی استفاده نمود. هر پرایمر و یا جفت پرایمر، Oligo تجزیه و تحلیل های مختلف را به همراه اطلاعات مفیدی مانند DNA و ساختار ثانویه RNA، پرایمرهای نادرست، ترکیبات و خواص فیزیکی مفید و ... را نشان می دهد.
قابلیت های کلیدی نرم افزار Oligo:
- طراحی پرایمر ها
- تجزیه و تحلیل پرایمرهای پی سی آر
- طراحی و تجزیه و تحلیل انواع پروب ها
- پردازش گروهای فایل ها
- تشخیص جهش های ژنتیکی
- نمایش ترکیب های مفید هر پرایمر
- و ....