دانلود نرم افزار آنالیز ساختار دی ان ای و آر ان ای Gene Codes Sequencher v5.4.6 Build 46289
نرم افزار Gene Codes Sequencher شاید زیاد در داخل ایران شناخته شده نباشد و افراد کمی از آن استفاده کنند اما این برنامه بسیار کاربردی در زمینه های NGS ، آنالیز SANGER DNA ، آنالیز SNP و بسیاری کاربردهای دیگر نظیر کاربردهای آنالیز ژن نیز می باشد. برای استفاده از این برنامه باید از کرک یا فعال ساز آن استفاده کنید که در ادامه با توضیحات کامل آن با شما خواهیم بود. اگر مشکل خاصی برخوردید در کامنت ها اعلام کنید.
نرم‌افزار Gene Codes Sequencher یکی از نرم‌افزارهای قدرتمند و پرکاربرد در تحلیل و تفسیر داده‌های سیکوئنسینگ است. این نرم‌افزار با دارا بودن امکاناتی نظیر انجام مواردی از جمله ترکیب، تفسیر و تحلیل داده‌های سیکوئنسینگ، تشخیص خودکار هموئولوگ‌ها، نمایش گرافیکی و پیش‌بینی ساختارهای سه‌بعدی پروتئین، تجزیه و تحلیل تنوع ژنتیکی و موارد دیگر، برای پژوهشگران و دانشجویان علوم زیستی و پزشکی بسیار مفید است.
Gene Codes Sequencher با دارا بودن یک رابط کاربری کارآمد و ساده و نیز پشتیبانی از فرمت‌های مختلف ورودی و خروجی، به کاربران این امکان را می‌دهد تا به سادگی داده‌های سیکوئنسینگ خود را وارد کنند و با استفاده از ابزارهای مختلف این نرم‌افزار، آن‌ها را تحلیل و تفسیر کنند.
همچنین Gene Codes Sequencher دارای امکاناتی نظیر امکانات ویرایش و بازسازی توالی‌های سیکوئنسینگ، تشخیص و حذف هموئولوگ‌ها، تحلیل چند ژن با هم، تحلیل فاصله ژنتیکی و ساختار سه‌بعدی پروتئین و نیز انجام مواردی مانند تشخیص SNP و تعیین پلی‌مورفیسم‌های طولی می‌باشد.
Sequencher نرم افزاری برای سنجش، اعمال تغییرات و آنالیز انواع ساختار های دی ان ای، الگوریتم های توالی نسل بعدی و کانتیگ ژن است. شما قادرید هر گونه عملیاتی مانند بازسازی ساختار دی ان ای، تجزیه و تحلیل سانگر، آنالیز SNP و ... را به راحتی توسط این نرم افزار به انجام برسانید. به علاوه این نرم افزار یکپارچگی کاملی با مجموعه Cufflinks suite دارد که به این ترتیب کاربران می توانند به راحتی تمامی رشته های آر ان ای را تجزیه و تحلیل کنند. همچنین این نرم افزار می تواند از تمامی رشته ها و توالی های دی ان ای و آر ان ای نمایی گرافیکی به همراه جداول و نمودار های جامع ارائه دهد.
قابلیت های کلیدی نرم افزار Sequencher:
- ویرایش، بازسازی و تجمیع توالی ها
- ترازبندی همزمان چند توالی
- نقشه برداری و ارزش بندی ساختار ها
- تشخیص و تجزیه و تحلیل SNP
- تجزیه و تحلیل خودکار توالی ها و ساختار ها
- نمایش گرافیکی ساختار های دی ان ای و آر ان ای
- ارائه گزارش، نمودار و جداول کاملا گرافیکی
- یافتن ساختار های آمینو اسید
- ترجمه خودکار جداول واریانس
- امکان سفارشی سازی محیط نرم افزار
- نمایش و ویرایش الگوریتم های تعیین توالی نسل بعدی
- و ...
Sequencher
Sequencher empowers the benchtop scientist by bringing the latest peer-reviewed NGS algorithms out of the command line and into an intuitive point and click interface. Whether performing reference-guided alignments, de novo assembly, variant calling, or SNP analyses, Sequencher has the tools you need to get results. Sequencher has integrated the comprehensive Cufflinks suite for in-depth transcript analysis and differential gene expression of your RNA-Seq data.
Sequencher can easily generate unique visualizations of your RNA-Seq data with custom plots and charts giving you publication-ready graphics in seconds. Sequencher's extensive Sanger analysis features are the foundation it was built upon. Customizable from start to finish there is no other program that offers you as much power as Sequencher. With an easy to use interface that has been honed over 25 years, first time users will feel like a pro in minutes. Everything from trimming reads, custom assembly and alignment algorithms, variation tables, summary reports, annotation; the list goes on and on. Come see why Sequencher has been published in tens of thousands of research articles, and peer-reviewed journals. Power with Simplicity.
Here are some key features of "Sequencher":
- Sequence Editing
- Sequence Trimming
- Sequence Assembly
- Assemble to Reference
- Multiple-Sequence Alignment
- Restriction Mapping
- Confidence Values
- SNP Detection
- Automated Analysis
- FastQC Quality Control Reports
- RNA-Seq
- De Novo Assembly
- Reference-Guided Alignment
- Variant Calling with SAMtools
- Multiplex ID
- SNP Analysis
- Methylation Studies
- RNA-Tolerant Alignment
- Viewers
- Customize your Workspace
- Find Amino Acids
- Variance Table
- Translated Variance Table
- Reports
- BLAST and Local-BLAST
- Primer-BLAST
- MUSCLE and Trees
سیستم مورد نیاز
- Windows 7 and higher
- 3 GB RAM (working with NGS data requires more RAM, at least 16 GB recommended. Additonal RAM may be required for large datasets.)
- 280 MB hard disk space for Sanger DNA analysis and an additional 580 MBs for NGS-Seq Analysis
راهنمای نصب
1- نرم افزار را نصب کنید.
2- Sequencher RLM Server را نصب کنید.
3- از مسیر C:Program Files (x86)Gene CodesSequencher Server فایل Stop RLM Server.bat را اجرا کنید تا RLM server متوقف شود.
4- فایل های rlm.exe, genecodes.exe و genecodes.lic موجود در پوشه Crack را کپی کرده و در مسیر C:Program Files (x86)Gene CodesSequencher Server جایگزین فایل های قبلی نمایید.
5- اکنون با اجرای فایل Start RLM Server.bat سرویس RLM server را دوباره فعال سازی کنید.
6- نرم افزار را اجرا کنید و به ترتیب بر روی Active Sequencher و Install Licence کلیک کنید. حال فایل genecodes_host.lic موجود در پوشه Crack را آدرس دهی/انتخاب کنید تا نرم افزار فعالسازی شود.
