دانلود نرم افزار مشاهده، ویرایش و آنالیز توالی های ChromasPro v2.1.3 - DNA

یکشنبه 06 شهریور 1401
احسان

دانلود نرم افزار مشاهده، ویرایش و آنالیز توالی های ChromasPro v2.1.3 - DNA

سلام خدمت همراهان ژنیک. امروز با یه نرم افزار دیگه در حوزه بیوانفورماتیک در خدمتتون هستم به نام ChromasPro (کروماز) که به شخصه هنوز استفاده ای ازش نکردم ولی خب سعی می کنم در آینده باهاش کار کنم و در صورت لزوم براش یه پست آموزشی هم قرار بدم(هنوز آموزش هیچ نرم افزاری رو نزاشتم😂 ). خب نرم افزار مشخصه کارش چیه آنالیز توالی، بهتون مقدار بازهای آلی رو فک کنم بده با همپوشانی و جایگاه های آنزیم های برشی رو میده که البته تعدادی از این موارد رو میشه تو نرم افزارهای مثل SnapGene و Gene runner دید و چیز جدید و خاصی نیست. دوست دارم مطالب بیشتری بزارم و واقعا نرم افزارها رو کم کم آموزش بدم اما متاسفانه یکم گرفتارم ولی سعی میکنم از مهم ترینا مثل Oligo شروع کنم. در ادامه ببینیم سایت های مختلف چه نکاتی رو راجب این برنامه گفته اند.

کرومازپرو

سلام به همه دوستان علاقه مند به بیوانفورماتیک و ژنتیک. در این پست قصد دارم با شما درباره یکی از نرم افزارهای کاربردی و مفید در زمینه آنالیز توالی های DNA صحبت کنم. نرم افزاری که منظورم هست ChromasPro است. این نرم افزار را می توانید از سایت رسمی آن به آدرس https://technelysium.com.au/wp/chromaspro/ دانلود کنید. این نرم افزار با سیستم عامل های ویندوز XP, Vista, 7, 8 و 10 سازگار است و حجم آن تنها 4.8 مگابایت می باشد.

ChromasPro چیست؟

ChromasPro یک نرم افزار بیوانفورماتیکی است که به شما اجازه می دهد تا توالی های DNA را از فایل های مختلف و برنامه های مختلف وارد کنید، ویرایش کنید، آنالیز کنید و مدیریت کنید. شما می توانید با استفاده از این نرم افزار ترتیب دقیق نوکلئوتید ها را در یک مولکول DNA بدست آورید و توالی های صحیح را شناسایی کنید. همچنین می توانید توالی های خود را با پایگاه های داده NCBI مقایسه کنید و ORF ها، آنزیم های برشی، کروماتوگرام ها و ترجمه پروتئین را ببینید.

ChromasPro چه قابلیت هایی دارد؟

ChromasPro دارای قابلیت های زیر می باشد:

- وارد کردن توالی ها از فرمت های مختلف مانند Applied Biosystems, Staden Chromatogram (SCF), MegaBace (.esd), 454 SFF, FASTA, FASTQ, EMBL, GenBank, SwissProt, GenPept, GCG RSF و متن خام (plain text).
- ویرایش توالی ها با استفاده از ابزارهای مختلف مانند حذف داده های با کیفیت پایین، جستجو و جایگزینی، برش، الحاق، تغییر رنگ، تغییر سطح زوم و ...
- آنالیز توالی ها با استفاده از عملکردهای مختلف مانند تشخیص همپوشانی ها، نشان دادن نقاط دارای ابهام، جستجوی ORF، نشان دادن آنزیم های برشی، ترجمه پروتئین، جستجو (nucleotide و protein BLAST) در پایگاه های داده NCBI، همردیف سازی چندگانه و ...

ChromasPro یک دستیار کامپیوتری در زمینه ژنتیک است و برای افرادی که بایستی پروژه های تعیین توالی DNA متعددی را مشاهده، ویرایش، آنالیز و مدیریت کنند، بسیار کاربردی خواهد بود. می توان از این نرم افزار برای وارد کردن جزئیات توالی از چندین برنامه و انواع فایل های توالی ژنتیکی استفاده نمود. تعیین توالی DNA به زیست شناسان و دیگر متخصصان امکانی را می دهد تا ترتیب دقیق نوکلئوتید ها را در یک مولکول DNA پیدا کنند و این فرایند می تواند با استفاده از روش ها و برنامه های کاربردی که هدف اصلی شان افزایش دقت تخمین ها است به پایان رسد. هدف اصلی این برنامه فراهم نمودن ابزاهای موردنیاز برای آنالیز و ویرایش دیتا های ژنتیکی جهت بررسی دقیق تر، تشخیص هم پوشانی ها برای رفع ابهامات و کشف توالی های صحیح است. ChromasPro امکان واردکردن داده و ذخیره ی فایل نهایی در قالب فرمت های Applied Biosystems, Staden Chromatogram (SCF), MegaBace (.esd), 454 SFF, FASTA, FASTQ, EMBL, GenBank, SwissProt, GenPept, GCG RSF و متن خام (plain text) را دارا می باشد.

قابلیت های کلیدی نرم افزار ChromasPro:
- تشخیص همپوشانی ها و نمایش خودکار نقاط دارای ابهام برای ویرایش
- استفاده از داده های با کیفیت برای حذف داده های دارای کیفیت پایین و بهبود توالی های تشخیص داده شده
- مشاهده فایل های ژنوتیپ Genescan
- جستجوی ORF
- چاپ کروماتوگرام ها
- جستجو (nucleotide و protein BLAST) در پایگاه های داده NCBI
- ایجاد کروماتوگرام ها و توالی مکمل یا معکوس
- ترجمه توالی
- همردیفی چندگانه
- امکان کپی کروماتوگرام ها برای قرار دادن در اسناد دیگر
- و ...

ChromasPro

ChromasPro is a practical tool for the users who need to manage multiple DNA sequencing projects. You can use this program to import the sequence details from multiple programs and file types. DNA sequencing allows biologists and other specialists to find out the exact order of nucleotides in a DNA molecule. The process can be completed by using various methods and applications that aim to increase the accuracy. This program aims to provide you with the required tools for analysing the imported sequences and editing the data in order to improve the sequence assembly. It is also able to detect overlapping sequences in order to display the ambiguities.

The interface is simple and allows you to quickly create a project and import the sequences that you need to analyze. Once loaded, you can assemble the sequences into contigs, edit the consensus file and export the entire alignment.

An important tool is the Restriction Analysis which enables you to search for certain elements in the nucleotide sequence. The program includes multiple databases of restriction enzymes and allows you to add new items by entering the recognition data.

Besides analyzing the nucleotide structure, the application is capable of formatting the data in order to easily publish your results or share them with other colleagues. Thus, you can export the sequence as a PDF or plain text file with minimum effort.

ChromasPro has the following features:
- Open and save sequences in Applied Biosystems, Staden Chromatogram (SCF), MegaBace (.esd), 454 SFF, FASTA, FASTQ, EMBL, GenBank, SwissProt, GenPept, GCG RSF and plain text formats.
- Assemble overlapping sequences into a consensus and automatically display ambiguities for editing.
- Use quality data to automatically remove low quality sequence and improve sequence assembly.
- View Genescan genotype files.
- Generate restriction site and fragment maps, and list cutters, non-cutters and fragments.
- Map open reading frames, aided by a G+C frame plot, and translate ORFs with one click.
- Print chromatograms, restriction site and fragment maps, and open reading frame maps.
- Perform nucleotide and protein BLAST searches through the NCBI web site.
- Perform multiple alignments by interfacing with ClustalW.
- Reverse & complement sequences and chromatograms.
- Search for sequences by exact matching or optimal alignment.
- Display translations when editing nucleotide sequences.
- Perform reverse translations and plot nucleotide degeneracy.
- Plot hydrophilicity and antigenicity of proteins.
- Copy an image of a chromatogram section for pasting into documents or presentations.

سیستم مورد نیاز

- Compatible with Windows XP, Vista, 7, 8, 10.

مشخصات

شرکت سازنده: Technelysium Pty Ltd
نام انگلیسی: ChromasPro
شماره نسخه: v2.1.3
نام فارسی: کرومازپرو
حجم فایل: 4.8 مگابایت
تاریخ انتشار: 10:41 - 1395/10/17 | 2017.01.06
منبع: پی سی دانلود / www.p30download.ir

راهنمای نصب

1- نرم افزار را نصب کنید.
2- محتویات پوشه Cracked file را در محل نصب نرم افزار* کپی و جایگزین فایل (های) قبلی کنید.
3- نرم افزار را اجرا کنید.

* محل نصب نرم افزار: پوشه محل نصب معمولاً در درایو ویندوز و داخل پوشه Program Files قرار دارد. همچنین با این روش می توانید محل نصب را پیدا کنید:
- در ویندوز XP: بعد از نصب، روی Shortcut نرم افزار در منوی Start کلیک راست کرده و روی گزینه Properties و سپس روی گزینه Find Target کلیک کنید.
- در ویندوز 7: بعد از نصب، روی Shortcut نرم افزار در منوی Start کلیک راست کرده و روی گزینه Open file location کلیک کنید.
- در ویندوز 8: بعد از نصب، روی Shortcut نرم افزار در صفحه Start Screen کلیک راست کرده و روی گزینه Open file location کلیک کنید، در پنجره ایی که باز می شود مجدداً روی Shortcut نرم افزار کلیک راست کنید و روی گزینه Open file location کلیک کنید.
- در ویندوز 10: بعد از نصب، روی Shortcut نرم افزار در منوی Start کلیک راست کرده و روی گزینه Open file location کلیک کنید، در پنجره ایی که باز می شود مجدداً روی Shortcut نرم افزار کلیک راست کنید و روی گزینه Open file location کلیک کنید.